深圳地铁1、2、3、4、7、9号线双向的运营时间都为06：30～23：00，而地铁5号线黄贝岭方向运营时间为06：30～23：03，前海湾方向为06：30～23：00 。
深圳地铁1号线罗湖方向运营时间为06：30～23：00，机场东方向为06：30～23：00 。地铁2号线赤湾方向运营时间为06：30～23：00，新秀方向为06：30～23：00 。地铁3号线益田方向运营时间为06：30～23：00，双龙方向为06：30～23：00 。
深圳地铁4号线清湖方向运营时间为06：30，福田口岸方向为06：30～23：00 。地铁5号线黄贝岭方向运营时间为06：30～23：03，前海湾方向为06：30～23：00 。地铁7号线西丽湖方向运营时间为06：30～23：00，太安方向为06：30～23：00 。
深圳地铁9号线红树湾南方向运营时间为06：30～23：00，文棉方向为06：30～23：00 。而深圳地铁11号线福田方向运营时间为06：30～23：30，碧头方向为06：28～23：34 。

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