1、发行机构不同，国债由财政部发行，国开债则由国家开发银行发行 。
2、债券类型不同，国债属于政府债券，国开债属于金融债券 。
3、免税待遇不同，国债的利息收入可以免除个人所得税，而国开债则没有免税优惠，需要在投资者所得利息中扣除25%的个人所得税 。
4、票面利率不同：相同期限的国开债的票面利率一般要高于国债 。
5、无论是国债还是国开债，两者的信用风险都是很低的，不过投资者要注意利率风险：在其他条件不变的时候，债券的价格一般与市场利率呈反比 。

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