纳帕海湿地周边有10个马场，是周边12个村小组村民的主要经济收入来源，有部分牵马线路在保护区的实验区内，存在水退牵马进、水进牵马退的情况。2020年，香格里拉市开展纳帕海湿地周边马场运营专项整治，对10个马场进行规划改造和规范管理，将牵马线路远离湿地及保护区。
“保护纳帕海湿地，老百姓的生活没有受到影响，除了有生态补偿，还有发展生态旅游的收入，老百姓还主动去保护湿地，看到有游客开车进湿地或钓鱼，老百姓都会去制止。”陈志明说。
在纳帕海湿地北岸山坡上有一栋孤零零的小楼房，这就是纳帕海自然保护区保护局下属的纳帕海管护所，陈志明和两位同事就长年驻守在这里，每天他们都要开车环绕湿地巡查两遍。虽然人少任务重，但他们不觉得孤单，因为管护局在周边村社中聘请了25名村民当村社管护员，村社管护员月工资1600多元。村社管护员每天都会巡查周边保护区，监测候鸟，用民族语言宣传保护知识。“我们还经常救助受伤的候鸟，每年都会救助10多次。”陈志明说。
在管护人员和周边村民的共同呵护下，近年来纳帕海越冬候鸟种群及数量逐年增多，越冬候鸟近5万只。2019年，纳帕海首次出现数量众多的度夏鸟类，白骨顶等候鸟在纳帕海繁殖变留鸟；2020年，纳帕海度夏鸟类数量及种类较2019年有所增加，度夏鸟类数量达2000余只。黑鹳原来经常独居，但在纳帕海喜欢上了群居生活，过去黑颈鹤三、四月份就飞走，现在有些黑颈鹤停留到七、八月份才飞走。
“如果黑颈鹤等一、二类保护动物在纳帕海繁殖，那就说明纳帕海的生态更好了。”在陈志明看来，纳帕海还缺乏生物多样性保护的专业人才，急需建立纳帕海湿地保护联合管理机制，加强治理纳帕海水质污染及综合保护。

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