鸡蛋的蛋白和蛋黄里都含有一定量超标的大肠杆菌和其他的菌落,如果鸡蛋不煮熟就吃的话很容易引起肠胃不适 。
另外，生蛋清中含有一种对人体有害称为亲合素的蛋白质 。这种蛋白质在肠道中能与生物素等紧密结合，成为一种稳定而无活性的复合物，从而妨碍生物素的吸收 。生物素是一种水溶性维生素，是人体内羧化酶的辅酶，参与二氧化碳的固定和羧化反应 。如果摄入大量的生蛋清，就有可能患生物素缺乏症，表现为全身乏力，感觉过敏，皮屑性皮炎，嘴唇鳞状上皮细胞脱落、脱屑等症状 。

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