海胆一般都有毒的 ， 在食用之前需要进行一系列的去毒工作 ， 科学合理的食用可以预防中毒；
在海胆中有两种产生毒素的器官：叉棘和棘 ， 在生殖季节摄食海胆的生殖腺和卵巢或被棘或叉棘鳌刺会引起中毒 ， 已报道过的白棘三列海胆、球海胆、毒海胆、石笔海胆等数十种海胆都是有毒的 ， 海胆毒素的作用各不相同 ， 有的对动物可引起呼吸困难、肌肉麻痹、抽搐以至死亡 ， 有的对动物红细胞有溶解作用 ， 并能引起心脏的激活和使肌肉对非直接性刺激不起反应 ， 具有潜在的药用价值 。
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