苍山洱海自然保护区主要保护对象为高原淡水湖泊及水生动植物、南北动植物过渡带自然景观、冰川遗迹 。区内具有明显的七大植物垂直带谱，保存着从南亚热带到高山冰漠带的各种植被类型，是世界高山植物区系最富有的地区 。本区已鉴定的高等植物有2849种，其中国家重点保护植物26种，同时还是数百种植物模式标本的产地 。苍山花卉，品种繁多 。云南的八大名花，即山茶花、杜鹃花、玉兰花、报春花、百合花、龙胆花、兰花、绿绒蒿，在苍山都能寻找得到踪迹 。其中，仅杜鹃花品种就有41种，从山脚直到海拔4100米的积雪地带，层层叠叠，成片成簇 。苍山也是野生动物的乐园 。这里气候适宜，植被茂密，至今还生活着鹿、麂、岩羊、野牛、山驴、野猪、狐、雉鸡以及少数的珍稀动物如麋鹿（四不像）等 。

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